在《孤岛惊魂5》中保存游戏进度的方法如下：
手动保存
使用手柄的玩家可以在游戏暂停时点击手柄的菜单键进行保存。
使用键鼠的玩家可以按下ESC键打开游戏暂停菜单，然后选择保存选项。
自动保存
游戏会在一些关键节点自动保存玩家的进度。
保存提示
保存操作完成后，屏幕右上角会有小点在闪烁，表示保存成功。
如果保存失败，游戏会再次提示用户。
CPY未加密版本：
`我的文档\CPY_SAVES\CPY\UPLAY\1803`
Steam版本：
`X:\Steam\userdata`
Uplay版本：
`X:\Ubisoft Game Launcher\savegames`
请根据您的游戏版本和平台，选择相应的存档位置进行保存操作。