小米6作为小米的旗舰手机，虽然拥有不少优点，但也存在一些缺点，以下是小米6的一些主要问题：
屏幕问题
顶部漏光问题，极个别有斜纹，可能是JDI屏幕问题。
取消3.5mm耳机插孔，用户需要使用蓝牙耳机或转接器。
性能问题
骁龙835处理器在某些情况下可能会导致手机发热或自动重启。
拍照问题
拍照发绿问题，可能是小米手机的通病。
后置摄像头拍照素质不佳，与同期旗舰手机相比有差距。
做工和设计问题
手机缝隙较大，做工有待提高。
后盖缝隙大，容易积累灰尘。
续航和充电问题
3350毫安电池续航一般，勉强能支持一天一充。
充电重启问题，小米官方表示会进行修复。
其他问题
WiFi断流和无规则重启问题，小米官方正在诊断中。
呼吸灯只有白色，音量键和电源键有些松动。
产能和库存问题
初期备货不足，导致用户难以购买。
取消耳机孔和采用Type-C接口，牺牲了一定的用户体验。
软件更新问题
用户反映系统更新速度不如以前快。
以上问题中，有些是可以通过软件更新或小米官方的后续支持来解决的，而有些则可能是由于设计或生产过程中的缺陷导致的。小米6在性能、拍照和设计上都有不错的表现，但屏幕、做工和续航等方面的问题可能会影响用户体验。