使用纳豆机制作纳豆的基本步骤如下：
准备黄豆
取适量干黄豆，通常为300~600克，用水冲洗干净后浸泡12小时左右。
蒸豆
将泡好的黄豆放入蒸锅中蒸熟，高压锅大约需要30分钟，普通锅约60分钟，直至黄豆可以用拇指与食指捏扁。
拌入调料
取适量白糖和味精，一般推荐3勺白糖和2勺味精，拌入蒸好的黄豆中。
冷却黄豆
将蒸好的黄豆从蒸锅中取出，放入消毒后的容器中冷却至50摄氏度以内。
溶解菌种
准备一个玻璃杯，用开水冲洗后浸泡3分钟，然后倒入适量凉白开水或纯净水，溶解纳豆菌粉。
接种菌种
将溶解好的菌液均匀喷洒在黄豆上，并迅速搅拌，然后迅速将黄豆倒入发酵杯中，并盖上外盖。
发酵
将发酵杯放入纳豆机中，设定发酵时间为12小时，温度通常设置在40℃左右。
钝化
发酵完成后，将纳豆倒入密封容器中，放入冰箱冷藏钝化8小时左右。
以上步骤完成后，纳豆即可食用。根据个人口味，可以添加适量的酱油、精盐、葱花、香菜等调味品。
请根据您的纳豆机型号和说明书进行具体操作，因为不同型号的纳豆机可能有些许操作上的差异。