在Adobe After Effects（AE）中合并图层可以通过以下几种方法实现：
使用“预合成”功能
选中需要合并的图层。
右键点击，选择“预合成”。
在弹出的“新合成”窗口中设置合成的尺寸、时长等参数，并点击“确定”。
使用快捷键
选中要合并的图层。
按下 `Ctrl + Shift + C` 打开预合成窗口。
点击确定。
使用蒙版
选中需要合并的图层。
右键点击，选择“新建蒙版”。
将选中的图层拖动到蒙版图层下面。
设置混合模式为“遮罩”。
使用合并路径
选中需要合并的形状层。
右键点击，选择“合并路径”。
在新形状层中对这些形状进行操作。
以上步骤可以帮助你在AE中合并图层。