三方协议丢失后的处理方式如下：
未落实就业单位
登报声明：在学校所在地省级及以上的报纸上刊登声明，声明原三方协议作废，内容包括姓名、专业、就业协议书编号等。
下载补办申请表和申请书：从高校网站下载就业协议补办申请表和补办就业协议申请书。
提交补办材料：将登报声明的报纸、补办申请表和申请书提交给就业指导服务中心审核，该中心会在学校就业网和就业宣传栏进行公示，公示期一般为3天。
领取新协议：在公示无异议后，毕业生可以到就业指导中心领取新的三方协议。
已落实就业单位
单位原因丢失：如果三方协议丢失是因单位原因造成的，由原单位出具就业协议书丢失证明，内容包括丢失原因等。
登报声明：同样需要在报纸上刊登声明，声明原三方协议作废，内容包括姓名、学校、专业、就业协议书编号等。
下载补办申请表和申请书：从高校网站下载就业协议补办申请表和补办就业协议申请书。
提交补办材料：将登报声明的报纸、补办申请表、申请书以及单位出具的人事接收函提交给就业指导服务中心审核，该中心会在学校就业网和就业宣传栏进行公示，公示期一般为3天。
领取新协议：在公示无异议后，毕业生可以到就业指导中心领取新的三方协议。
建议
及时登报：一旦发现三方协议丢失，应尽快在报纸上刊登声明，以防止他人冒用。
按流程补办：严格按照学校或就业指导服务中心提供的流程进行补办，确保补办过程顺利。
保留相关证据：补办过程中，确保所有提交的材料真实有效，并保留好所有相关文件，以备后续使用。