慧根并不是指身体某个具体部位。在佛教中，慧根通常被视为一种与生俱来的智慧或悟性，它包括基因、胎儿在母体内的营养和环境因素，以及后天的学习和修行。慧根与人的良知、道行或儒家所说的“良知”有相似之处，都指人内在的一种天生的智慧和成长能力。
慧根的形成与人的婴儿期记忆有关，婴儿期记忆为慧根提供了通道和模式，使语言平台向自然境界切换。慧根在人的成长过程中逐渐显现，有的人可能表现得比较明显，有的人则相对晦暗。
慧根可以通过后天的修行得到增长，修行有助于提升人对佛经和佛法的理解能力。慧根与人的行为和言论有关，有慧根的人通常能说出符合大道的话，或对人生有透彻、洒脱的认识。
需要注意的是，慧根是一个比喻性的概念，它不同于生理上的某个具体部位，而是一种比喻，用来描述人的智慧潜力和成长能力