代扣个人所得税的计算方法如下：
确定应纳税所得额
应纳税所得额 = 税前收入 - 减除费用（5000元/月）- 专项扣除（五险一金）- 专项附加扣除 - 依法确定的其他扣除。
应用超额累进税率
根据应纳税所得额，查找适用的税率和速算扣除数。
应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。
计算实发工资
实发工资 = 应发工资 - 四金（五险一金） - 缴税。
具体步骤
计算税前收入
税前收入包括工资薪金、劳务报酬、稿酬所得、特许权使用费所得等。
扣除减除费用
从税前收入中减去5000元的基本减除费用。
扣除专项扣除
专项扣除包括“五险一金”，即养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险和住房公积金。
扣除专项附加扣除
根据个人情况，扣除子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或住房租金、赡养老人等专项附加扣除。
扣除其他依法确定的扣除
可能包括捐赠等依法确定的其他扣除项目。
确定适用税率和速算扣除数
根据调整后的应纳税所得额，查找适用的税率和速算扣除数。
计算应纳税额
应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。
计算实发工资
实发工资 = 应发工资 - 四金 - 缴税。
示例
假设某员工的应发工资为15000元，五险一金为2000元，没有其他扣除项目。
计算应纳税所得额
应纳税所得额 = 15000 - 5000 - 2000 = 8000元。
应用超额累进税率
根据税率表，8000元属于第2级，适用税率为10%，速算扣除数为252元。
应纳税额 = 8000 × 10% - 252 = 548元。
计算实发工资
实发工资 = 15000 - 2000 - 548 = 12452元。
建议
建议在计算个人所得税时，详细列出所有扣除项目，确保准确无误。
若有专项附加扣除或其他依法确定的扣除项目，应充分了解并正确扣除。
若对税率和速算扣除数有疑问，可咨询当地税务机关或专业税务顾问。