中华鲟主要分布在中国的长江流域。它们是中国的珍稀保护动物，对于维持长江流域的生态平衡至关重要。历史上，中华鲟的分布范围较广，包括渤海沿岸、旅顺、辽东湾、辽河、黄河、山东石岛、钱塘江、宁波、闽江、台基雄及珠江水系等地。然而，目前中华鲟在黄河、闽江、钱塘江和珠江中的野生种群已经绝迹，仅在长江中还有其踪迹，但野生状态个体的数量明显减少。
中华鲟是一种底层、洄游或半洄游性鱼类，它们在5-6月常集群于河口，秋季上溯至江的上游进行繁殖。中华鲟的产卵场通常选在江面宽窄相间、有深水急滩、下有宽阔石砾或卵石的河床。
为了保护中华鲟，政府和相关组织已经采取了一系列措施，包括减少污染物排放、禁止捕捞、恢复和改善水生态系统等，以保护其栖息地并促进物种保护。