在《尼尔：机械纪元》中，存档的方法主要有以下几种：
通过序章后基地保存
完成游戏的序章后，回到基地见司令，之后可以开始执行任务。
在基地中寻找数据上传机器进行快速保存。
使用键盘上的ESC键
按下ESC键打开系统菜单，选择保存游戏。
注意，这种保存方式通常需要在保存点范围之内。
在技能栏中装备可存档显示
在技能栏中装备特定的技能，这样可以在小地图上看见哪里有存档点。
检查游戏安装文件夹路径
确保游戏安装文件夹路径全为英文，避免中文路径导致存档问题。
确保完成第一个任务
检查是否有传送器保存点
寻找游戏中的传送器保存点进行存档。
检查文档文件夹
确保在文档文件夹下存在`My Games\NieR_Automata`的文件夹，并在其中找到存档文件`SlotData_0.dat`等。
请根据以上方法尝试进行存档。如果仍然存在问题，可能需要检查游戏是否为最新版本或尝试重新安装游戏