根据提供的信息，清朝皇帝办公的地方主要集中在紫禁城内的几个重要宫殿。以下是皇帝办公的主要地点：
乾清宫：
乾清宫是清朝皇帝处理日常政事的地方，包括上朝议政、听取军政大臣的奏本和处理紧急要务。
养心殿：
从雍正时期开始，养心殿逐渐成为皇帝处理政务的主要场所，皇帝在这里批阅奏折，和军机大臣密谈。
金銮殿（太和殿）：
虽然金銮殿是举行国家大典的地方，但皇帝日常办公并不在这里，它更多是用于举行重要典礼。
南书房：
在康熙时期，南书房的翰林有时会帮皇帝起草诏旨，但这不是皇帝的主要办公地点。
军机处：
军机处是处理机密政务的地方，虽然它不是皇帝的办公地点，但它是皇帝决策的核心团队所在地。
此外，根据季节和特殊情况，皇帝可能会在宫外的避暑山庄等地处理政务。