科目二缺考的处理方式如下：
补考：
如果因故未能按时参加考试，可以在十日后重新预约考试。
重新预约考试：
在驾驶技能准考证明有效期内，科目二预约考试的次数不得超过五次。如果第五次预约考试仍不合格，已考试合格的其他科目成绩作废。
取消预约：
如果已经预约考试但因故不能参加，应提前一日申请取消预约。
缺考处理：
如果未按时参加考试，会被直接判定为不及格，并记为零分。
补考费用：
重新预约考试时，可能需要缴纳补考费用。
取消预约的流程：
如果需要取消预约，可以拨打客服电话咨询情况，或者持身份证到当地车管所取消预约，或者让驾校代为取消。
请合理安排时间，避免不必要的缺考