抵扣联的处理通常遵循以下步骤：
发票抵扣联认证
将抵扣联拿到税务局进行认证，确保其真实性和合法性。
认证相符的专用发票抵扣联、认证结果通知书和认证结果清单应单独装订成册，并妥善保管以备税务稽查。
账务处理
在做账时，将增值税专用发票的记账联贴在凭证后面。
根据发票认证后的结果，进行相应的会计分录处理，如确认进项税可抵扣时，借记相关费用或原材料等科目，贷记应交税费-应交增值税-进项税。
发票保管
将抵扣完的发票整理好，并按照进项发票的厚度使用装订封面进行包装。
使用夹子夹起整理好的抵扣联，并用订书机或针线进行装订。
发票遗失处理
如发生发票抵扣联遗失，需在《中国税务报》上刊登“遗失声明”。
在当地税务局网站办理登载手续，并到税务机关查验。
如果抵扣联在丢失前已经认证相符，可以使用专用发票发票联复印件留存备查；如果未认证，则需到主管税务机关认证，并留存专用发票发票联复印件。
发票归还
如果抵扣联与发票联一并丢失，需要联系销售方，请求其在网上办税服务厅作废原发票并重新开具正确的发票。
发票管理政策
企业应设置成本核算政策，确保发票抵扣联被正确使用，避免因使用不当引起的财务损失。
请根据您的具体情况选择合适的处理方式。