合法的Python标识符应该遵循以下规则：
1. 标识符由字母（大小写敏感）、数字和下划线组成，必须以字母或下划线开头。
2. 标识符不能以数字开头。
3. 标识符不能是Python的关键字或保留字，例如`if`、`for`、`while`等。
4. 标识符不能包含空格或其他特殊字符，如`!`、`@`、``等。
根据这些规则，以下选项中合法的Python标识符是：
A. `stu_name`
B. `class`（Python关键字，不能作为标识符）
C. `3B9909`（以数字开头，不符合规则）
D. `it's`（包含特殊字符`'`，不符合规则）
因此，正确答案是A. `stu_name`